国家重点实验室 
       集成芯片与系统全国重点实验室 
       脑功能与脑疾病全国重点实验室
       应用表面物理国家重点实验室
       遗传工程国家重点实验室
       聚合物分子工程国家重点实验室
       心脏病全国重点实验室（参与共建）
       克服递药屏障高端制剂全国重点实验室（参与共建）
       光伏科学与技术全国重点实验室（参与共建）
       大型客机集成技术与模拟飞行全国重点实验室（参与共建） 
国家应用数学中心
       上海国家应用数学中心
国家医学中心
       国家儿童医学中心（上海）
       国家传染病医学中心
       国家神经疾病医学中心
国家临床医学研究中心
       国家老年疾病临床医学研究中心
       国家放射与治疗临床医学研究中心
国家制造业创新中心
       国家集成电路创新中心
国家产教融合创新平台
       国家集成电路产教融合创新平台
国家野外观测台站
       上海长江河口湿地生态系统国家野外科学观测研究站
教育部前沿科学中心
       脑科学前沿科学中心
教育部集成攻关大平台
       新一代集成电路技术集成攻关大平台
上海数学中心
       上海数学中心