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应用离子束物理教育部重点实验室
生物多样性与生态工程教育部重点实验室生命科学学院
非线性数学模型与方法教育部重点实验室数学科学学院
聚合物分子工程教育部重点实验室高分子科学系
医学分子病毒学教育部重点实验室上海医学院
分子医学教育部重点实验室上海医学院
波散射与遥感信息教育部重点实验室信息科学与工程学院
公共卫生安全教育部重点实验室公共卫生学院
癌变与侵袭原理教育部重点实验室中山医院
现代人类学教育部重点实验室(在建) 生命科学学院

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教育部先进涂料工程研究中心材料科学系
教育部网络信息安全审计与监控工程研究中心信息科学与工程学院
教育部创新科学仪器工程研究中心化学系

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卫生部糖复合物重点实验室上海医学院
卫生部抗菌素临床药理重点实验室华山医院
卫生部手功能重建重点实验室华山医院
卫生部卫生技术评估重点实验室公共卫生学院
卫生部医学分子病毒学重点实验室上海医学院
卫生部听觉医学重点实验室眼耳鼻喉科医院
卫生部近视眼研究重点实验室眼耳鼻喉科医院
卫生部病毒性心脏病重点实验室中山医院
卫生部新生儿疾病重点实验室儿科医院

上海市重点实验室

上海市现代应用数学重点实验室数学科学学院
上海市分子催化与功能材料重点实验室化学系
上海市智能信息处理重点实验室信息科学与工程学院
上海市周围神经显微外科重点实验室华山医院
上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室上海医学院

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