除自然科学奖项目外，凡推荐申报技术发明奖、科技进步奖的候选项目，必须办理科技成果登记手续。自然科学奖、技术发明奖、科技进步奖分为一等奖、二等奖、三等奖 3个等级。上海市科技成果与奖励网址：www.stcsm.gov.cn/jlb。软件下载：上海市科学技术奖项目推荐系统。

上海市科技功臣

授予在当代科学技术前沿取得重大突破或在科学技术发展中有卓著贡献；在科技创新、科技成果转化和高技术产业化中，创造巨大经济效益或者社会效益的科学技术工作者。

上海市自然科学奖

授予在基础研究和应用基础研究中阐明自然现象、特征和规律，做出重大科学发现的个人、组织。推荐自然科学奖项目提交的主要论文、专著，到推荐截止日应公开发表1年以上。对涉及与国外合作完成的研究项目，推荐自然科学奖时，应当由国外合作者或机构提供书面证明，说明我国学者在该研究中的学术贡献。

上海市技术发明奖

授予运用科学技术知识做出产品、工艺、材料及其系统等重大技术发明的个人、组织。推荐技术发明奖项目的核心技术应当获得了相应的知识产权证明或者已经申请了相应的发明专利。并提交相关知识产权证明。对于符合技术发明奖授奖范围，但专利法规定不授予专利权的公益成果，应当出具规范的项目查新报告。

上海市科技进步奖

授予在科学技术研究与开发、科技成果转化和高技术产业化中以及完成重大科学技术工程、计划、项目以及在科普、软科学等方面做出突出贡献的个人、组织。推荐科技进步奖项目应用技术成果必须得到推广应用，并商品化、产业化，取得良好的经济与社会效益。工程类项目必须工程结束并投入使用运行，工程还未结束的阶段性成果报奖一律不予受理。

上海市国际合作奖

国际科技合作奖授予对本市科学技术事业做出重要贡献的外国人或者外国组织。

上海市自然科学牡丹奖

上海市自然科学牡丹奖（以下简称牡丹奖）是经市政府批准设立，由企业资助的市级科技奖励。牡丹奖主要奖励在自然科学基础研究工作中做出突出成绩的本市中青年科技人员。牡丹奖工设数理、化学、信息、材料工程、医学与药学、生物与农业6个学科组，每两年评选一次，每个学科组每届最多评选1名。2002年9月，上海市科学技术委员会与中国工商银行上海市分行签订牡丹奖评选活动协议。